101位：対カゲの女王戦3/ペーパーマリオRPG

ラストダンジョン「やみのきゅうでん」の最深部で対決する本作のラストボス「カゲの女王」の最終形態戦で流れるBGMです。

100位：Sex pervert of a silence /カラス

本作の真の最終ボス「神の像」との戦闘で流れる曲。けたたましいほどのキック(バスドラム音)が鳴り響く曲で、メロディらしいメロディはほとんど無く、最初から最後まで同テンポのキック音が続く、人気の高い一曲です。

99位：Megalith -Agnus Dei-/エースコンバット04 シャッタードスカイ

本作の最終ミッション「メガリス -MEGALITH-」で流れるBGMで、全編コーラスを使ったオーケストラサウンドで、荘厳かつ悲愴感に満ち溢れた楽曲です。エースコンバットシリーズのミッションBGMでは、初めて本格的にコーラスを使った曲として話題になりました。

98位：全てを支配せしもの/ラストストーリー

本作のラストバトルで使用される楽曲で、出だしからお経のような唸り声による上記の言葉が無音の状態から流れ、その後に植松節全開のメロディーが唐突に開始されます。謎の叫声が流れたりするなど、かなりインパクトのある曲です。

97位：BOSS SCENE 7/ダライアス

BOSS SCENE 7とは、タイトーの横スクロールSTG、ダライアスのBGMで、ラスボス戦ということもあってか、同作品内でも非常に人気のある曲です。

96位：Second Armageddon /カードマスター リムサリアの封印

最終ボスである「リムサリア」の第2形態との戦闘で流れるBGMで、オープニングなどで使用されていた本作のメインフレーズもしっかり入っており、ラストバトルに相応しい熱い楽曲になっています。

95位：おまえが闇の正体か/ミスティックアーク

本作のラスボス「じゃしん」との戦いで流れる曲で、プレイヤーからは「自分自身との戦いが震える感じがする」「何だか燃えてきた」などと絶賛されています。

94位：へっぽこ魔王最強伝説/ぷよぷよフィーバー

へっぽこ魔王最強伝説とは、ゲーム｢ぷよぷよ｣シリーズに流れるBGMで、ラスボス｢ポポイ｣との戦闘時に流れます。ぷよぷよフィーバーシリーズのBGMの中でも高い人気を誇り、Wii版ぷよぷよ!、ぷよぷよ7にも収録されています。

93位：FINAL OF PUYOPUYO /す～ぱ～ぷよぷよ

Final Of Puyo Puyoは、サタン(SATAN)戦 ステージBGMとして人気の曲で、ファンからは「自然に体がノッてくる」「めちゃめちゃテンションが上がる」と絶賛されています。

92位： 亡き王女の為のセプテット/東方紅魔郷　～ the Embodiment of Scarlet Devil.

紅魔郷６面ボス　レミリア・スカーレットのテーマで、激しくアグレッシブなメロディーはテクノサウンドのようでテンションが上がります。

91位：An Earnest Desire of Gray /ラジアントヒストリア

ニンテンドー3DS用ソフト『ラジアントヒストリア パーフェクトクロノロジー』のラスボス戦で流れるBGMで、ゆったりとした壮大なメロディーが人気です。

90位：デラーリン戦/カエルの為に鐘は鳴る

カエルの為に鐘は鳴るの登場キャラクターでゲロニアン軍率いてミルフィーユ王国を侵略した魔王、デラーリンとの戦いのBGMです。

89位：決戦！/バハムートラグーン

浮遊世界オレルスを舞台に繰り広げられる、シミュレーションRPG「バハムートラグーン」の曲で、ラスボス戦で流れてきます。オリジナルサウンドトラックの中でも人気の曲です。

88位：Despair/スーパーロボット大戦D

『スーパーロボット大戦D』でラスボスを務める「ペルフェクティオ」が駆る“ファートゥム”の戦闘アニメで流れるBGMで、パイプオルガンを思わせる荘厳なイントロから、一気に曲が展開する激しい音楽で、1ループ1分弱のやや短い曲ではあるがインパクトは強烈です。

87位：最終決戦? /ぷよぷよ～ん

最終決戦?は、ぷよぷよ～んのラスボスとの戦いで流れるBGMで、作・編曲は吉田順一氏が担当しています。ぷよぷよらしからぬメロディーが話題になりました。

86位：ドロシアソーサレス/タッチ！カービィ

パイプオルガンを主軸に据えたゴシックで荘厳な曲。2ループ目に入ると本作の他の楽曲同様、電子音が中心の音色に推移していきます。なつかしのBGMに設定変更していると、『夢の泉デラックス』版の「夢の泉」（グルメレースのアレンジ曲）になります。

85位：チョロQシティ「PARTY ROOM」/チョロQ3

ハイパーグランプリの最終戦コースである「チョロQシティ」で流れるBGMで、とても爽やかで明るい曲で、「PARTY ROOM」の通りまるでパーティのようなお祭り感のある楽しげな音楽です。

84位：覚醒/ゼノギアス

覚醒とはPS用RPG『ゼノギアス』で使用された楽曲で、デウス戦で流れます。スピード感溢れる激しい曲で、サビの部分でOP曲の「冥き黎明」と同じフレーズが使われており、同時に聴こえるヨイクのようなコーラスが、覚醒した「神」との最後の戦いを盛り上げます。

83位：The Justice Ray Part2/サンダーフォースV

九十九氏が手掛けた様々な作品で使用されているが、基本的にシューティングゲームのラスボス戦で使用されていて、初代の「The Justice Ray」は『ブラストウインド』のラスボス戦で使用されました。

82位：封印解放/ブルードラゴン

封印解放は、人気のファイナルファンタジー シリーズの音楽の多くを作曲したことで有名な植松伸夫氏によってプロデュースおよび作曲された曲で、静かな曲調から疾走感あふれる激しい曲調に切り替わるあたりが人気の理由になっています。

81位：The 3 Karma/シャドウハーツII

まさに戦闘曲と言ったような、実に気合の入った１曲で、聴いているだけで何か一つの物語の中へ入り込んでしまったような、そんな感覚に陥ります。

80位：INTOLERANCE/レイストーム

INTOLERANCEとは、アーケード用STG『レイストーム』で使用された楽曲です。ラスボスであるYGGDRASILLとの戦闘で流れる。印象的な心音のイントロから始まり、人類の終焉を暗示させるかのような悲壮感と神秘性を兼ねた壮大な曲です。

79位：悪の化身/ドラゴンクエストIV 導かれし者たち

「悪の化身」は、「ドラゴンクエストIV 導かれし者たち」のラスボス曲として人気を博しています。この曲を聴くと初代ダイの大冒険を思い出すユーザーも多くいるようです。

78位：BT ”ultimate”/アンリミテッド・サガ

「BT ”ultimate” 」は、アンリミテッド：サガの各主人公のシナリオにおける最終ボス「カオス・ルーラー」との戦闘で流れるBGMです。曲がクライマックスに達すると同時に一気に転調。繊細なピアノのメロディーが始まり曲調が”動”から”静”へと移り変わる。構成の方も実にドラマチックであり、ラストバトルらしい非常に盛り上がるものとなっています。