A.D.600年、中世の時代にて登場。魔王に仕える魔王三大将軍の筆頭にして、三魔騎士の一人。性格は狡猾な策略家かつ傲慢な一面を併せ持ちながら、臆病な程に慎重かつ保守的。平仮名表記で妙に間の抜けた英語を口走るのも特徴の一つ。魔王に対しては絶対的な忠誠を誓っているが同時に畏怖もしており、終盤で決着をつける際にはクロノたちの仲間になった魔王に対して「何故、我らを裏切った…」「共に魔族の世界を作るという夢は嘘だったのか」と非難しながらも頭が上がらなかった。

作中に登場するモンスターの一種。あくまでも元から自然界に存在していたモンスターであり、人工的に造られた魔法生物が自立した魔族とは別物である。同作に登場するヌゥと共に、スピンオフ作品『時空冒険ヌウマモンジャー』の主人公も勤めている人気キャラです。

ロボ(プロメテス)と同じ、R-Yタイプのロボットで、戦闘中の名称はアトロポス145。女性的なパーソナリティを設定されており、塗装はピンク色で水色のリボンを付けている。人類を排除してロボットによる支配を目指すR-Yタイプ製造工場メインコンピュータ「マザーブレーン」にプログラムを改造されて手先になっており、ロボとの一対一の対決の末に大破。機能停止間際に改造される前に退避させておいたメモリーが起動して元の人格を取り戻し、ロボにリボンに使われている部品を託しました。

中世（A.D.600）の時代に存在した人物で、作中では既に故人。カエルことグレンの幼い頃からの親友であり、聖剣グランドリオンに選ばれた勇者だった。A.D.590頃、ガルディア王国の騎士団長を務めた後に、グレンと共に魔王討伐の旅に出るが、デナドロ山での魔王との闘いでグランドリオンを折られ、グレンを逃がすために魔王に捨て身で跳びかかり絶命します。

A.D.600年、中世の時代にて登場。魔王に仕える三大将軍、三魔騎士の一人。外法剣士ソイソーの異名を持つ。青肌とスキンヘッドの魔族。武人然とした性格で、正々堂々とした戦いを好む。主君である魔王への忠誠も厚く、散り際にも魔王のための戦いに身を投じ本懐を遂げられたと、「我が人生に悔いなし！」の台詞を遺している。

中世（A.D.600）の時代に登場するガルディア王国の王妃。マール（イラスト右側）の祖先にあたる。マールの祖先ということもあり外見がそっくりで、夫であるガルディア21世も彼女と王妃の区別がつかなかった。またカエルとは旧知の仲であり、それぞれ表立っては見せないが互いに慕っている描写が見られます。

本作のラスボス。原始時代（B.C.65,000,000）に赤く輝く隕石のような姿で地球に飛来し、アザーラを巻き込んでティラン城付近へと落下。奇しくもこれによりティラン城が崩壊し、人類と恐竜人の戦いを終わらせることにもなった。

A.D.600年、中世の時代にて登場。魔王に仕える三大将軍、『三魔騎士』の一人。『空魔士マヨネー』の異名を持つ。一見すると巨乳の美女だが、実はオカマ(ニューハーフ)である。作中では事前にマヨネーを知っていたカエル、及び喋らないクロノ以外の味方が揃ってオカマであった事実に驚愕しており、攻略本に掲載されている公式イラストでの彼は何処からどう見ても女性としか思えない。

主人公(クロノ)の母親。猫好きなのか、自宅で猫を一匹飼っている。意外と世間に疎いのか、愉快な仲間達を連れてきても普通に挨拶を交わす。クロノが裁判に掛けられた際は、さすがに心配していたが、死亡した時は事情を聞かされていない為に猫の心配をしていたという天然キャラ。

時の最果てにひとりたたずむ老人で、その正体は古代ジール王国三賢者のひとり。クロノ死亡後には彼の復活のために「クロノ・トリガーを授けてくれます。タイトルと同じ名前のアイテムが手にはいったときは、その用途も含めて少し感動するポイントでもある。

現代のガルディア国王。マールの父。真面目で融通が利かないところがあるが、マールのことは自分なりに心配している。高血圧のため、パレポリの「ハイパー干し肉」を苦手としている。

ガッシュは古代 (B.C.12,000) のジール王国において「理の賢者」と呼ばれ、人々の尊敬を集める人物。廃墟のドームで機械仕掛けのヌゥとともに暮らし死の山について研究している老人。その正体はタイムマシン「シルバード」の開発者でもあり、古代ジール王国3賢者のひとり「理の賢者です。物語が進むと死亡し、ヌゥに自らの意識を移植。実はこのキャラも続編であるクロノ。クロスにも登場し、クロノ・クロスのストーリーにおいても非常に重要な存在となります。

イベント「緑の夢」で戦争で砂漠化した森を蘇らせようとする壮大な計画を抱く女性。何を植えてもすぐに枯れてしまうのは砂漠に潜むモンスターの仕業であることをフィオナから聞いたクロノたちは砂漠に潜むモンスターを倒します。モンスターを倒したことをフィオナに伝え感謝されますが、今度は砂漠の緑化計画に膨大な時間がかかることが問題となります。ここでフィオナの手伝いをしてこれをなんと400年間続けます。その400年後にクロノたちによつて回収され、無事に緑化させることに成功します。

千年祭で武器を討つていたメディーナ村の外れに住む鍛冶屋の老人。その正体は古代ジール王国3賢者のひとりで、命の賢者と呼ばれていた。ドリストーンという特殊な素材を加工する技術を持ち、物語においても重要な役割を果たすキャラ。

酒場で酔いつぶれたカエルが落とした勇者バッジを偶然拾ってしまった少年。それが原因で勇者として崇められることに。いたずら好きで臆病な普通の村の少年ですが、彼が勇者として魔王を倒しに行くエンディングも存在します。そのとき魔王城で意外な人物が魔王の代わりにタータを待ち受けています。

エイラに好意を抱く青年で、後にエイラの後を継ぎイカオ村の酋長になります。当初は嫉妬心からクロノたちをよく思わず時間移動に使うゲートホルダーを盗み出すこともする。しかしエイラに怒られると改心。追加エンディングではキーノがエイラからドリストーンの組み込まれた指輪を受け取り、二人が婚約する様子が描かれています。

登場回数の少ないザコ敵ながら、それだけの役割に留まらず、イベントによる登場やセリフがあること、また本作に登場するモンスターの中で唯一の女性モンスターであることから、一部のプレイヤーに強く印象を残すキャラクター。

古代（B.C.12000）の登場人物で、浮遊大陸で暮らす「魔法王国ジール」の女王。かつては先代国王であった夫のあとを継いだ優しい性格の女王だったが、魔法の力を持つ自国の発展の為にラヴォスの力を利用しようとしている内に（このこと自体が元から古代世界にあった魔力を持つ者と持たざる者との民族格差と差別感情を増長させる結果にもなっている）、ラヴォスエネルギーに触れた事で次第にその力に魅入られてしまい、ラヴォスを絶対的な神と崇めて、いつの間にか国のためではなく自分の為だけに永遠の命を手にする野望を抱きます。

B.C.12000年、古代に登場するジール女王に仕える側近の1人。橙と青の二色を基調としたマントと装束を纏っているのが特徴。側近という立場に恥じない魔力を持った優秀な魔導師だが、出世欲が強く自己中心的で尊大な性格の持ち主。ジールへの忠誠心はほぼ皆無であり、彼女の子供であるサラやジャキにも容赦が無い冷酷な一面も見せる。やられる直前にオナラ技「オナラぷ～」というなど、謎の愛されキャラです。

32号廃墟にいる暴走ロボ軍団を率いるバイク型ロボットで、スピードに全てをかけており、クロイ達とバイクレースで勝負をすることになる。簡単そうに見えてかなり難しく、ジョニーに勝つには相当な経験が必要と言われています。