あまりにも影が薄いという不運を背負わされた忍たま、その影の薄さぶりは群を抜いており、それは同じ委員会の先輩に当たる善法寺伊作にすらその存在を忘れられてしまうほど。唯一と言って良いくらい誉めても良いのは礼儀に厳しく、正義感は人一倍強いということ。

毒蛇・サソリ等の危険な生き物を数多く溺愛、飼育している通称「毒虫野郎」。飼育小屋から飼っている毒虫や毒蛇がしょっちゅう脱走(孫兵曰く外出)し、その度に大騒動を巻き起こすトラブルメーカーのため土井先生や一部の生徒から嫌がられています。ちなみにかまれた時に備えて火薬と火種を持ち歩いている。人よりペットを第一に考える危険な嗜好の持ち主だが、意外とロマンチストな性格。

忍者食研究家で、食堂のおばちゃんのピンチヒッターとして彼女の留守中に厨房を預かっているが、あくまで料理人ではないため腕の方はイマイチ。忍者食とは名ばかりのゲテモノ料理（乾燥ケムシなど）ばかりを開発するため、忍たま達からは敬遠されている。

性格は至って真面目で、自主トレや予習を進んで行っている上に復習もかかさない。自主トレをしすぎて忍術学園を破壊してしまうほど真面目な性格。常に自主トレを行っているので、それなりの戦闘力を持つと言われています。

普段は農業で暮らしているが、たまに忍者の仕事もする。名前の通り、三流のヒラ忍者だが、それなりの実力はある。ドクタケに潜入した時は給料をもらうため（乱太郎の学費）帰らなかった。

年齢的には六年生だが、忍術の経験が無いため四年生に編入した。一年生～五年生からは「タカ丸さん」と呼ばれ丁寧語で扱われるが、彼は五年生以上にはクンづけ(四年生以下は呼び捨て)で丁寧語は話さない。髪結いの習性からか傷んだ髪を見ると黙っていられない。

「落第忍者乱太郎」54巻で初登場。マツホド城の支城・ホドホド城跡で一人籠城していた少年。先祖代々マツホド城に仕える忍者の家柄であったが、曽祖父が現役の頃に戦で敗れ一晩でホドホド城が落城したために、どこの城にも雇って貰えなかったという不遇の時代を過ごす。熱い性格だが、笑いの沸点が極めて低く安藤先生のくだらないギャグでも笑ってしまう。

極端にマイペースで飄々とした性格。口癖は「おやまぁ」。常に無表情で、周囲の喧騒にも無関心な様子。穴掘りが得意で【穴掘り小僧】や【天才的トラパー】という異名を持ちます。

忍術学園の厨房を預かる中年女性で、ほぼ1人で学園全員分の食材調達・調理・後片付けを行っています。普段は包容力のある性格だが、相手が誰だろうとも絶対に食べ残しを許さない。残す者が有れば物凄い剣幕で怒り出し、先生方や来客であっても例外無く一切容赦しない。それでも残すと一週間食事を与えない、掃除などの雑用をさせるなどの罰がある。それゆえに「忍術学園最強」の異名を持ちます。

自称「学年一成績優秀」のナルシスト。自慢話をさせると長いため周囲からは煙たがられており、きり丸達に「性格はカス」と密かに評されている。影で勉学や戦輪の修練も怠らない努力家でもあり、成績優秀なのは事実で武道大会での優勝経験もある。

火器の腕は学年一と豪語する自称「忍術学園のアイドル」。アニメには1期から登場している古株である。持ち前の豪快な性格や自信家な所が災いして失敗することも多いが、その欠点を直すための努力も怠らない。火縄銃も得意で照星からも認められる腕前だが、実は狙撃は彼の趣味から外れた分野であり、火縄銃にメロメロな姿は見られない。

風魔流忍術学校の六年生。喜三太に大変親しまれており、面倒見の良い優しい先輩。優しく礼儀正しい性格ではあるが常に任務の際は冷静で、
風魔流忍術学校の中でも優秀な忍たまであり、先生の右腕としても活躍しています。

学園長の友人の曾孫で、元一年は組の教育実習生です。明るく朗らかな性格だがおっちょこちょいで失敗が多い、通称『とっちゃんぼうや』。重い鎖帷子を無理して身に着けたり忍者食しか食べずに空腹で倒れるなど、形から入って失敗するタイプ。

実戦経験豊富で優秀なくノ一だが、思慮浅い部分がありどこかパッとしない。明るく陽気で正義感は強い方だが、忍者らしいドライな食わせ物としての一面も持つ。教育実習終了後はドクタケ忍者隊の派遣忍者として働いており、学園の敵に回った事がある。

事務員志望の就職浪人の少年。忍者としての実力はそこそこあるものの、プロ忍者よりも楽で安全な事務員への就職を考え、忍術学園の事務員になることを画策。自分勝手な性格が災いして、結果不採用に終わります。忍術学園の事務員である小松田から職を奪うことを度々計画し、彼を目の敵にしています。

忍者に憧れており、元々はドクタケ忍者としての就職を希望していたが、ドクタケの実態を知ってからは就職試験を取りやめ、現在は忍術学園の事務員として働いている。マイペースで天然ボケ。基本的には穏和で誠実な人柄で、職員や生徒達からは好かれているが、困った小松田と言われキャラクターテーマソングでも「十を聞いたら九を忘れる」と言われるほどドジな所が多いへっぽこ事務員でマニュアル小僧。

他の五年生の例にもれず、面倒見が良く、乱きりしんからもいい人と言われている。公式では天然ボケとされており、21期では更にさわやかであるという設定が加わった。ノリがよく、お祭りは精一杯楽しむ派のようで、学園祭の話では屋台で様々なものを購入していた。万力鎖という両端に鎖のついた暗器の扱いに長けている。

ドクタケ6人衆の忍者でドクタケ忍者隊の隊員で、四角い顔で、常に困ったような表情が特徴です。ドクタケ6人衆の一人ということで戦闘力はそこそこ高いと言われており、冷静沈着です。

ドクタケ6人衆の忍者のひとり。細面が特徴で、よく尖った顎を突き出すように横を向いている。チョビ髭をはやしており、自然薯居士の指導でチョビっと幻術が使え、63巻で術を披露しています。

光鬼は、ドクタケ忍者隊隊員で、無精髭が特徴。冗談が通じない。初登場時は茶店の主人に化けて乱太郎達を毒殺しようとするも、乱太郎たちが「冗談」で頼んだゲテモノ料理を作ってしまったことにより料理に手を付けてもらえず、失敗に終わる。

ドクタケに仕える忍者隊の部隊長。妙におとぼけキャラの多い本作の例に漏れず、うっかり者、照れ屋、脳天気と忍者には向いてなさそうな男。しかもミュージカル好きでノリが良いため、歌に乗せて質問されると重要な機密も喋ってしまう。

ドクタケに新しく集められたフリーの忍者集団の一人で、ご老体のふりをして乱太郎たちを追跡することで情報を入手しようとします。厚着太逸からは優秀な忍者という評価を受けていました。

黒戸カゲは、くノ一歴30年、主婦歴20年の山ぶ鬼の専属教師です。人にものを教えるのが得意で土井先生が感心するほどの能力を持っており、経験豊富なドクタケ忍者教室の先生です。

忍術学園の道具管理主任兼用具委員会の顧問。騙し絵のような不思議な顔をしている。小松田のフォローに手を焼かされているが、本心では情が移っている。

ドクタケ忍者教室の講師で、アニメ版の音楽を手がける作曲家・馬飼野康二がモデルです。優秀な忍者だが抜けている部分があり感覚が鈍く、隠れている先生達の気配を察しながらも反対方向に話しかけるという事がお約束になっている。だが、その実力や知識は山田伝蔵に匹敵するほど。